雖然小的非編碼RNA測(cè)序數(shù)據(jù)的數(shù)量不斷增加，但仍然不清楚小RNA在人類(lèi)基因組中的代表程度。薩爾大學(xué)的研究人員已經(jīng)分析了來(lái)自近25,000個(gè)數(shù)據(jù)集的3030億個(gè)測(cè)序讀數(shù)來(lái)回答這個(gè)問(wèn)題。
研究人員確定，人類(lèi)基因組的0.8%被874,123個(gè)區(qū)域可靠覆蓋，平均長(zhǎng)度為31nt。在這些區(qū)域的基礎(chǔ)上，他們發(fā)現(xiàn)在已知的小型非編碼RNA類(lèi)別中，microRNAs是最普遍的。在隨后的步驟中，他們表征了miRNA的變體，并對(duì)11,877個(gè)候選miRNA進(jìn)行了分階段驗(yàn)證。其中，許多實(shí)際上在肺癌中表達(dá)并且顯著失調(diào)。最終的候選人最終通過(guò)北方污點(diǎn)進(jìn)行了驗(yàn)證。雖然分離的miRNA仍然可以存在于人類(lèi)基因組中，但我們提出的可能包含人類(lèi)miRNA的最大部分。
圖(A)描述了通過(guò)微陣列對(duì)人(候選)miRNA的首次驗(yàn)證。所有4297個(gè)成熟(候選)miRNA的聚類(lèi)熱圖，其基于無(wú)擴(kuò)增雜交在高質(zhì)量RNA樣品中顯示信號(hào)。圖(B)給出了一個(gè)代表性的例子，其映射分布如圖3所示。除了堆積圖之外，還顯示了二級(jí)結(jié)構(gòu)。圖(C)顯示了與肺癌(藍(lán)色)和對(duì)照樣品(橙色)雜交的人血液miRNA陣列的結(jié)果。結(jié)果顯示為熱圖，由頂層樹(shù)狀圖(樣本聚類(lèi))和左側(cè)(miRNA聚類(lèi))的層次聚類(lèi)產(chǎn)生。
標(biāo)注：本文摘自互聯(lián)網(wǎng)，已表明出處，如有侵權(quán)，請(qǐng)聯(lián)系我司，第一時(shí)間刪除。
滬公網(wǎng)安備31011702889603號(hào) 網(wǎng)站地圖